ANCES colabora con un gran número de organizaciones, tanto públicas como privadas, cumpliendo así con la misión de la asociación de representar a sus asociados y defender sus intereses de forma conjunta. Mantiene contactos principalmente con las siguientes entidades:
- Asociación Europea de CEEI/BIC (EBN - European Business and Innovation Centre Network).
- Ministerio de Industria, Comercio y Turismo. DG PYME
- Ministerio de Educación y Ciencia
- Ministerio de Trabajo y Asuntos Sociales
- Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI)
- Genoma España
- Empresa Naciona de Innovación, SA (ENISA)
- Instituto de Crédito Oficial (ICO)
- Escuela de Organización Industrial (EOI)
- Asociación de Parques Científicos y Tecnológicos (APTE)
- Federación Española de Entidades de Innovación y Tecnología (FEDIT)
Además ANCES colabora con varias Universidades, Oficinas de Transferencia de Resultados de Investigación (OTRIs), etc.